Stando così le cose è possibile che il marcio sia dentro al fusto. Il fatto di aver preso un colpo non comporta un grave danno se ciò non ha causato un taglio orizzontale. A questo punto, perso per perso, andrei a verificare lo stato delle radici e rinvaserei con del nuovo terriccio asciutto, poi assicurerei mediante legatura il fusto ad una piccola assicella per sostenere la pianta.
Tieni presente che in questa stagione è bene ritirare i Pachypodium in casa, vicino una finestra, dando loro acqua col contagocce e solo in caso di bisogno.
Riguardo i polloni (piccoli) non li terrei nello stesso vaso, sia perchè il terriccio potrebbe essere infetto a causa di possibili marciumi, e che cmq è troppo bagnato stando a quanto dici. Consiglio di far asciugare l'eventuale taglio per una decina di giorni, e di appoggiare quindi la talea su di un vasetto pieno di sabbia mantenuta lievemente umida fino a quando la prossima primavera non avrà emesso radici. Auguri pèr la riuscita dell'operazione.